Não está claro exatamente qual é o seu problema - você disse o que quer fazer, mas não por que deseja fazê-lo. AFAIK, Chameleon deve funcionar muito bem com uma partição de sistema EFI (ESP). Minha suspeita é que qualquer problema que você esteja encontrando é na verdade um problema com o firmware; algumas EFIs (incluindo a da Apple) têm problemas para inicializar no modo BIOS (o qual o Chameleon usa) se o disco usa a Tabela de Partição GUID (GPT) ou exigir que o MBR de proteção na GPT tenha certos recursos. O firmware da Apple, por exemplo, exige que o GPT tenha um MBR híbrido e que uma das partições no híbrido MBR tem seu sinalizador de inicialização definido. Assim, se você estiver usando o hardware da Apple, você pode tentar criar um MBR híbrido e definir o sinalizador de inicialização em uma de suas partições. Meu software GPT fdisk ( gdisk ) pode fazer isso. Verifique a documentação do Chameleon para ver se ele usa o sinalizador de inicialização do MBR para qualquer coisa; se assim for, pode ser necessário ter cuidado com a partição MBR que recebe esse sinalizador.
Se você estiver usando uma configuração do Hackintosh, fica mais complicado, já que os detalhes variam de uma implementação de firmware para outra. Eu também não tenho certeza se este site permite a discussão das configurações do Hackintosh. Se é isso que você tem, talvez seja melhor perguntar em um site do Hackintosh.