Eu encontrei uma solução para isso e provavelmente ainda funciona.
sudo -H gedit /var/lib/gdm/.gconf.mandatory/%gconf-tree.xml
Localize esta parte:
<dir name="accessibility">
<dir name="keyboard">
<entry name="enable" ... type="bool" value="true"/>
</dir>
</dir>
e defina enable
para false
.
Editar: eu mudei depois que postei isso e posso confirmar que ainda funciona. O ícone de acessibilidade desapareceu da tela de login.