HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\WindowsUpdate\Auto Update\AUOptions
Esta chave de registro permite que você altere as configurações de atualização. Por this pergunta do serverfault, defina o valor desejado nele é 2
Para a segunda parte, você quer ver os comandos assoc e ftype. Esta pergunta sobre o superusuário dá uma ideia de como configurá-los extensões para o que você quer. você só precisa usar um parâmetro como% ~ dp0 para expandir onde você está, então use o nome do caminho relativo para descobrir aonde seu caminho relativo levará. então use Ftype com esse caminho absoluto.
Isso explica mais sobre os parâmetros do lote