Este é um "recurso" em vez de um bug relacionado ao gerenciamento de energia de seu disco rígido externo não relacionado à formatação. Coisas que você poderia tentar fazer:
Desative o gerenciamento de energia do disco rígido no seu BIOS. Pergunte à Seagate como desativar o gerenciamento de energia em suas unidades USB externas.
Isso não é um problema do Ubuntu.