Acho que o comentário de Stefano pode ser a causa da lentidão da sincronização de arquivos. Esta situação é abordada no FAQ do Ubuntu One. link
A maioria dos usuários percebe esse problema quando adiciona um novo computador para sincronizar com a nuvem do Ubuntu One ou ativa uma nova pasta para sincronização ... mas geralmente acontece quando há muitos arquivos novos para sincronizar. A equipe do Ubuntu One tornou a melhoria dessa experiência uma prioridade para o ciclo Natty. A maioria dos aprimoramentos está no lado do servidor para que todos se beneficiem à medida que são implantados.
Se você vir a sincronização lenta de arquivos e souber que apenas alguns arquivos foram alterados, isso pode estar relacionado a uma interrupção temporária. A página de status do Ubuntu One é um ótimo lugar para verificar essas informações. link