Acabei de baixar a versão mais recente do Skype no OSX 10.8.4 - vejo a opção em "Avançado", enquanto não posso definir alternativas (a opção 80/443 na captura de tela do Windows) - parece você quer bloqueá-los de qualquer maneira ... Então, isso não parece ser um problema da minha compreensão.