Eu costumava ter o mesmo problema, embora meu notebook (Asus K53SC) tivesse cerca de 20 meses quando o problema surgiu. Os sintomas foram os mesmos: ACPI interrompe comendo um CPU a 100%, o ventilador está constantemente funcionando com o que parece ser a velocidade máxima. Eu instalei o Ubuntu e o problema também estava lá (GPE06 no meu caso).
A causa do problema foi ... poeira! Eu desmontei e limpei meu notebook e as interrupções desapareceram tanto no Windows quanto no Ubuntu.
Veja o que eu encontrei após a desmontagem:
Comparecomlimpo:
Guia de desmontagem