(postagem como resposta conforme sugestão)
Os formatos de contêiner / codec, taxas de bits de áudio / vídeo e muitos outros parâmetros de codificação podem explicar a diferença, embora, dependendo das especificações do seu PC, ele não tenha problemas em lidar com os dois. Verifique se o primeiro arquivo não está corrompido, tente remotamente (não re-codifique) antes de reproduzir e tente algo como PotPlayer em vez disso.
Além disso, forneça mais detalhes sobre os arquivos ( MediaInfo pode ajudar com isso).