Você só deve poder fazer este comando no terminal para alterá-los:
Move Window Buttons in Ubuntu 12.04/12.10
gsettings set org.gnome.desktop.wm.preferences button-layout 'close:'
Se você quiser alterar ainda mais o layout ou movê-los - o ":" especifica em qual lado da janela os máximos / min / próximos estão ativados. Você também pode alterar o layout do qual é com 'fechar, maximizar, minimizar' ou qualquer variação nele.
(Você só precisa de direitos de usuário e é persistente.)