É melhor prevenir do que remediar Sugiro que você faça um backup completo dos seus arquivos mais importantes em uma mídia externa, que não esteja conectada à máquina enquanto você estiver fazendo as alterações. Excluir e especialmente redimensionar partições é um risco, não alto, mas as coisas podem dar errado.
Eu definitivamente manteria uma cópia do antigo sistema / etc também é provavelmente algum se não todos / var procurar em arquivos de configuração antigos para dicas de reconfiguração do novo sistema.
Não tenho certeza do que você mantém na partição home, mas se não houver coisas inúteis, eu apenas montaria a partição home antiga no novo sistema em / home mountpoint e chown -R username.group / home / username para definir uid e gid. Eu não acho que .bashrc iria confundir qualquer coisa a menos que você tenha algumas configurações lá específicas para o sistema antigo. Dependendo do seu gerenciador de janelas, .gnome ou .kde podem atrapalhar mais. Você pode facilmente superá-los de qualquer maneira, renomeando-os antes do X (re) iniciar.