Bem, fiquei muito irritado quando vi este erro sozinho após atualizar o xampp.
Eu consertei isso instalando uma versão mais antiga do xampp em outro diretório (que incluía uma versão antiga do mysql) e, em seguida, logando no phpmyadmin. Então, consegui exportar os bancos de dados que não funcionavam na versão mais recente. (Minhas tabelas funcionaram na versão antiga, mas não na nova versão)
Nota Esta foi uma instalação do Windows. Minha versão antiga era o xampp 1.7.7, no qual o MySQL incluído era o MySQL Server 5.5