Você não precisa do arquivo ppk se não usar o PuTTY. Em vez disso, salve a chave privada de texto sem formatação em um arquivo.
mkdir -p ~/.ssh
open -e ~/.ssh/my-key
Cole a chave lá e salve. Agora, torne-o legível apenas pelo seu usuário:
chmod 600 ~/.ssh/my-key
Em seguida, use o SSH para se conectar:
ssh user@host -i ~/.ssh/my-key