Primeiro, note que - a menos que você esteja realmente, realmente certo de que isso é o que você quer - você provavelmente vai querer fazer algo completamente diferente, como o xinerama.
O que você descreve é uma configuração de vários assentos, que tem alguma documentação aqui . Inclui links para vários howtos específicos da distribuição.
Para realizar dois Xs individuais sem placas de vídeo separadas, você terá que usar o método Xephyr, já que o Xorg (aparentemente) não pode executar várias instâncias em um cartão (ou, no caso, um adaptador gráfico integrado ao processador ).