Acontece que o problema era que eu tinha instalado anteriormente o aplicativo necessário em Arquivos de Programas (x86) e, em seguida, o desinstalei.
Quando o reinstalei em meus Arquivos de programas personalizados, o Tipo de arquivo do aplicativo ainda estava apontando para Arquivos de programas (x86).
Usando FileTypeMan (como referenciado aqui ), eu apontei para o exe correto, e o aplicativo estava funcionalmente disponível para uso como um aplicativo padrão.