Eu tenho o TS-7800, que tem ethernet gigabit: link
No entanto, eles bifurcaram o kernel do Linux para este fórum. O kernel vanilla funciona, mas com algumas limitações, veja link
Alguém conhece uma placa-mãe para uma CPU compatível com ARM, com Gigabit Ethernet? Eu dei uma olhada no Beagleboard (que na verdade é mais do que apenas uma placa-mãe) e em alguns outros, mas eu só consegui encontrar 10/100 MBit Ethernet.
Uma opção alternativa seria modificar um gabinete NAS, como synology ou lacie. Eu acredito que existem fóruns de modding / hacking por aí. Ambas as empresas enviam sistemas gigabit ethernet baseados em armas.
Ou considere o arduino, agora há uma placa de 96Mhz (Megahertz, suficiente para muitos aplicativos). Pode haver um complemento para isso. Os livros da O'Reilly também têm bons guias sobre arduino e sistemas embarcados.