Não importa. Quando você cria uma nova máquina no VBOX, ele pergunta qual arquitetura você deseja que a máquina tenha (no primeiro menu, quando você escolher configurações pré-configuradas para sistemas operacionais).
Na verdade, mesmo em uma máquina real de 64 bits, os 32 bits funcionarão. No entanto, não é otimizado para a arquitetura.