Eu também vi isso.
Eu não tenho uma solução, mas tenho uma solução alternativa ( echo 3 | sudo tee /proc/sys/vm/drop_caches ) e potencialmente mais informações para que alguém possa levar a investigação adiante.
Não é um problema de rede, porque em "Lendo a lista de pacotes ..." , está apenas lendo arquivos em /var/lib/apt/lists/ . A:
strace -tt -T -fo strace.log apt-get update
dá:
16394 14:43:03.921130 open("/var/lib/apt/lists/gb.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_precise_main_binary-i386_Packages", O_RDONLY|O_LARGEFILE) = 7 <0.000012>
[...]
16394 14:43:03.995238 read(6, "-3.1ubuntu2)\nConflicts: linux86\n"..., 32444) = 32444 <0.000111>
16394 14:43:05.787187 read(6, "c (<< 1:14.b.4-dfsg), erlang-exa"..., 32239) = 32239 <0.000069>
16394 14:43:05.788025 read(6, ".deb\nSize: 42130\nMD5sum: c7de671"..., 31695) = 31695 <0.000068>
16394 14:43:05.870734 read(6, "5: 29c4b395a92bdc12932f151c3643a"..., 31607) = 31607 <0.000071>
16394 14:43:05.890862 read(6, "e-pack-af-base\nFilename: pool/ma"..., 32538) = 32538 <0.000070>
16394 14:43:05.891425 read(6, "buntu-usb-live, ubuntu-dvd-live,"..., 32090) = 32090 <0.000066>
16394 14:43:05.891960 read(6, "cd9755b03ac2c9b8251125c7b6618\nDe"..., 32195) = 32195 <0.000034>
16394 14:43:06.043001 read(6, "rg>\nArchitecture: all\nVersion: 2"..., 32535) = 32535 <0.000072>
Veja como essas chamadas de sistema de 8 read levaram mais de 2 segundos, embora cada chamada individual leve menos de 1 ms.
Executando time apt-get update ou observando top , esse processo não está ocupado entre essas duas chamadas. Então, por que o atraso?
Então eu fiz:
echo t > /proc/sysrq-trigger
algumas vezes e analisou o resultado em kern.log :
apt-get D 00000000 0 16790 12706 0x00000000
e8695d30 00000086 f7bd5e6c 00000000 f7bd5e44 f74a6580 c1990e00 c1990e00
efe46efe 000042cb f7b9de00 e71a7230 f74a6580 c107e116 00000000 00000000
044aa200 00000000 00000000 00000000 00000000 e8695d0c e8695d0c c1038de8
Call Trace:
[<c107e116>] ? enqueue_entity+0x186/0x220
[<c1038de8>] ? default_spin_lock_flags+0x8/0x10
[<c15e13bd>] ? _raw_spin_lock_irqsave+0x2d/0x40
[<c15e0533>] schedule+0x23/0x60
[<c15deecf>] schedule_timeout+0x12f/0x290
[<c1075c38>] ? ttwu_do_activate.constprop.86+0x58/0x70
[<c1055190>] ? usleep_range+0x40/0x40
[<c15e0846>] io_schedule_timeout+0x86/0xd0
[<c15cef7d>] balance_dirty_pages.isra.17+0x3f5/0x4b4
[<c15e118d>] ? _raw_spin_lock+0xd/0x10
[<c1180781>] ? __set_page_dirty_buffers+0x81/0xb0
[<c110deb5>] ? set_page_dirty+0x55/0x60
[<c11812c9>] ? __block_page_mkwrite+0xe9/0x170
[<c110f3ae>] balance_dirty_pages_ratelimited_nr+0xde/0x100
[<c1126f53>] do_wp_page+0x503/0x830
[<c1128ef7>] handle_pte_fault+0x267/0x2c0
[<c1129c62>] handle_mm_fault+0x1e2/0x280
[<c15e4988>] do_page_fault+0x158/0x4c0
[<c104e4dc>] ? irq_exit+0x5c/0xa0
[<c15e22d0>] ? do_debug+0x180/0x180
[<c15e4830>] ? vmalloc_fault+0x195/0x195
[<c15e1c53>] error_code+0x67/0x6c
Portanto, não tenho certeza do que isso significa, mas da aparência das falhas de página, portanto, aponta para um possível problema de gerenciamento de memória.
Eu então tentei um:
echo 3 >/proc/sys/vm/drop_caches
E isso fez com que o problema desaparecesse.
Agora, parece muito um problema no kernel. Então, eu atualizei para o kernel mais recente (3.8 backport de raring ) e é aí que eu estou. Vai atualizar se o problema persistir com o kernel mais novo.
Editar
O problema persiste com o novo kernel, embora não tão ruim. E a mesma coisa,
echo 3 | sudo tee /proc/sys/vm/drop_caches
apaga o problema por um tempo. Eu só vi isso acontecer em laptops MSI (Nome do produto: CR61 2M / CX61 2OC / CX61 2OD).
Editar dezembro de 2015
Como confirmado por btrace aptitude / apt-get , parece que há alguma E / S de disco no momento. Ele tem um arquivo temporário ( /var/cache/apt/pkgcache.bin.<random-chars> ) mmapado na memória, e é por isso que ele não aparece na saída strace .
Ainda não é possível explicar por que isso acontece apenas em algumas máquinas, por que deixar de usar caches ajuda, por que a mudança para 64 bits ajuda.
Se alguém puder reproduzi-lo, um teste interessante pode ser para ver se isso também acontece ao ser executado em eatmydata ou se mover /var/cache/apt para tmpfs ou um ramdisk ajuda.