Isto é apenas teoria - eu não tentei, e pode haver alguns passos complicados envolvidos na criação:
Você pode formatar sua nova partição como VFAT e, em seguida, copiar os arquivos necessários (o diretório i386) e as partes necessárias de FreeDOS sobre isso.
Então você pode ajustar sua configuração do Grub para incluir seu novo sistema de arquivos, então reinicialize no FreeDOS.
De lá, você deve conseguir executar o programa de instalação do Windows.