Tenha em mente que top exibe 3 médias de carga. Esta é a linha da minha caixa:
load average: 0.02, 0.08, 0.12
O primeiro número é a média de um minuto, o segundo é de 5 minutos e o terceiro é de 15 minutos. Se você está apenas olhando para a média de um minuto, isso não é bom o suficiente. A regra padrão é que a carga não deve ser maior que 1 em um único núcleo, 2 para dual core, etc. Então, por exemplo, digamos que você esteja executando uma caixa quad core. Qualquer coisa acima de 4 está sobrecarregada. Dito isto, você pode ver picos na média de um minuto, mas os 5 e os 15 minutos ainda podem estar bem.
Outra explicação pode ser encontrada aqui: link