Não que isso resolva seu problema, mas você deve ter a linha:
SetHandler wsgi-script
A linha:
AddHandler wsgi-script .wsgi
já garante que qualquer coisa com extensão .wsgi seja processada por mod_wsgi. Adicionar SetHandler servirá apenas para fazer com que você scripts .cgi não sejam mais exibidos como scripts CGI. Além disso, você não seria capaz de armazenar mais arquivos estáticos no servidor.