Você pode usar um dos seguintes aplicativos para obter o emulador do xWindows em suas janelas:
Ao usar o Exceed, tudo o que você precisa fazer é marcar uma caixa de seleção "Ativar o encaminhamento do X11" em seu Putty ao se conectar ao ssh. Então simplesmente digite "emacs" enquanto estiver no console e você terá o Emacs rodando em uma GUI no seu Windows. Eu não usei o Xming, mas suspeito que ele deva funcionar de maneira semelhante.