export LD_ASSUME_KERNEL=2.2.5 está definindo uma variável de ambiente do shell $LD_ASSUME_KERNEL to 2.2.5 . Os programas usam as variáveis de ambiente para ajudar a configurar vários aspectos de si mesmos (como a variável $TERM do shell indica que tipo de terminal deve ser emulado) e podem ser relativamente inofensivos. (Eu digo pode ser porque algumas variáveis são importantes, como a variável $PATH e $PS1 )
Se você quiser ver se $LD_ASSUME_KERNEL está definido antes de executar o aMSN, abra um terminal (como o Konsole ou Terminal) e digite echo $LD_ASSUME_KERNEL no prompt. Se uma linha em branco for produzida, $LD_ASSUME_KERNEL não está definida e o aMSN é padronizado para suas configurações e a configuração deixará o aMSN fazer o que for feito com essa variável. Se estiver definido, você substituirá o que estava lá com 2.2.5 quando você executar o aMSN.
Na minha cabeça, eu não reconheço imediatamente a variável LD_ASSUME_KERNEL , então acredito que você esteja seguro em executá-la. Se algo acontecer, você poderá sempre reinicializar, pois o comando export por si só não persiste durante as reinicializações. (Os scripts de sistema e de perfil pessoal são configurados em cada inicialização e login)