Se isso acontecer apenas no IE e não na sua área de trabalho, o IE ainda poderá estar usando o ClearType. Há uma configuração em Opções da Internet | Guia Avançado | Multimídia | "Sempre use o ClearType para HTML *".
Essa configuração também afeta os emails em HTML no Outlook.
Sou uma das pessoas de sorte que não suportam o ClearType e se esforçam para desativá-lo. No entanto, você também pode ajustar como o ClearType funciona usando este site e ClearType Tuner PowerToy . (Depois de fazer ajustes posso torná-lo aceitável para os meus olhos, mas eu odeio fazer isso para cada sistema que eu toco.)
Espero que esses ajustes ajudem.