Você pode obter uma imagem virtual ao vivo de sua partição do sistema operacional Windows com o Microsoft Dynamics, que fará uma captura instantânea da VM de seu estado atual. Você pode então mover este arquivo VHD para sua partição linux e usar o Virtualbox para usá-lo como uma VM e você terá seu sistema operacional Windows rodando no Linux.
Isso, obviamente, não fará alterações na sua partição do Windows.
Isso é o que eu faria.