Isso pode não funcionar para você e percebo que essa é uma pergunta antiga, mas minha experiência recente é que o seguinte funcionou nas últimas vezes que tive um problema * copiar texto de outro aplicativo e colá-lo no NetBeans: basta fechar qualquer janela do Chrome que eu tenha aberto e a pasta funcionará como um campeão.
Windows XP, NetBeans IDE 7.1, Google Chrome 17.0.963.56
* sintoma é que a pasta não faz nada. Colar a mesma área de transferência para aplicativos diferentes do NetBeans funciona bem.