Primeiro você parece um pouco confuso. Você não pode entrar em um servidor web usando um cliente FTP. Você acessa um servidor da Web usando um navegador da web.
Se você deseja remover arquivos da lista padrão de arquivos que um servidor da Web produzirá se não houver um arquivo de índice, talvez a maneira mais fácil seja escrever um programa cgi que excluirá os arquivos que você não deseja para ver e gerar os nomes devidamente formatados.