Eles obtêm suas configurações do back-end! :) É possível que você tenha duas máquinas com o mesmo nome de host? Isso pode fazer isso acontecer porque as configurações são armazenadas por nome de host. Você pode simplesmente usar o phpmyadmin e vasculhar a tabela mysql para ver as configurações manualmente.
Uma coisa para tentar ver se conserta é simplesmente alterar o nome do host, independentemente de você ter duplicados ou não: link