Você fez um bootrec / scanos antes de realizar as tarefas de reparo? Isso muitas vezes corrigiu isso para mim.
Além disso, isso pode ajudá-lo, acredito fixmbr é para discos mbr apenas não para discos gpt. Basicamente você tem que fazer uma letra de drive na partição do sistema efi usando diskpart e então iniciar a operação bootrec / fixboot dentro da partição. link
O que também pode ser o problema é o redimensionamento automático que essas ferramentas de backup costumam fazer, o que torna as partições do sistema necessárias inutilizáveis às vezes.
A melhor aposta é cloná-lo novamente usando outra ferramenta e escolher um layout manual, os fabricantes de ssd geralmente fornecem um que é otimizado para seu hardware, se não for um produto walmart.