Embora o Byobu não tenha uma tecla de atalho para isso, é possível mover as janelas usando a funcionalidade subjacente do Tmux. Veja a página do manual :
move-window [-ardk] [-s src-window] [-t dst-window] (alias: movew) This is similar to link-window, except the window at src-window is moved to dst-window. With -r, all windows in the session are renumbered in sequential order, respecting the base-index option.
Divulgação completa: Eu sou o autor e mantenedor do Byobu .