Exporte sua partição inicial com o samba e monte-a no Windows. É assim que eu faço.
Para esclarecer, se você não quiser montar / dirigir uma unidade, faça / home um link simbólico para \ yourmachine \ home (supondo que você tenha exportado sua casa dirija como '/ home').
Por exemplo, eu tenho / Documents apontando para // Bliss / Documents sob cygwin + bash, eu vejo (no meu diretório raiz):
Documents -> //Bliss/Documents/
No windows (cmd.exe) com dir, esse arquivo se parece com:
<SYMLINKD> Documents [\Bliss\Documents]
(Bliss é um nome para o meu servidor).
no Windows, eu crio isso em root pelo cd'ing para root, então (do bash - note aspas simples ao redor do nome do caminho do Windows com barras invertidas).
cmd /c mklink /d Documents '\Bliss\Documents'