Essa é uma pergunta muito complexa que é mais fácil de ser respondida instalando bootchart …
apt-get install bootchart
Agora, toda vez que seu sistema for reinicializado, ele criará um arquivo .png em /var/log/bootchart/ que contém não apenas a resposta à sua pergunta, mas também o tempo que cada comando levou, a utilização da CPU e do disco,… tudo você poderia perguntar sobre o processo de inicialização.
Exceto pela pergunta: "É um daemon upstart?" Eu diria "sim e não", mas sinta-se à vontade para decidir por si …