Eu uso e recomendo rdiff-backup para isso.
sudo apt-get install rdiff-backup
assumindo que você tenha acesso ssh ao servidor remoto:
sudo rdiff-backup /etc [email protected]::/remote-dir
Em seguida, eu configuraria o login com uma chave ssh.
Então você só precisa executar um cronjob como root. Coloque o comando no arquivo de configuração do cron:
sudo echo "rdiff-backup /etc [email protected]::/remote-dir" > /etc/cron.daily/etc_backup
e torná-lo executável:
sudo chmod u+x /etc/cron.daily/etc_backup
não tenho certeza se é necessário torná-lo de propriedade do root:
sudo chown root: /etc/cron.daily/etc_backup
Como alternativa , você pode fazer o backup em seu diretório de dropbox.
rdiff-backup /etc ~/Dropbox