Eu não estou familiarizado com o emacs, mas posso pensar em várias soluções:
1) Trabalhe em uma pasta NAS que, na verdade, é um sistema de arquivos que não está na máquina que você está executando, mas sim um compartilhamento NFS de CIFS. Não tem certeza de como isso funcionará se suas mangueiras de VM estiverem ativas
2) Crie uma macro personalizada que salvará o arquivo localmente e depois invoque um comando scp para enviar o arquivo alterado para outro lugar
3) Edite os arquivos na máquina que executa a VM e envie-a automaticamente para qualquer alteração na VM. Você poderia executar algo como abaixo em uma segunda janela de terminal
FILE=thenameofthefileIwanttoeditandsend
inotifywait -E CLOSE_WRITE $FILE && scp -p $FILE user@host:/target/folder/
Acima seria bom para execução única. Você também pode fazer um loop infinito:
FILE=thenameofthefileIwanttoeditandsend
while true; do inotifywait -E CLOSE_WRITE $FILE && scp -p $FILE user@host:/target/folder/; done
Nota: Isso pressupõe que você configure a autenticação de chave ssh sem senha, para que o scp não solicite credenciais.