Eu tive um grande sucesso usando a Link Shell Extension , usando o site Smart Copy
e Smart Mirror
opções (que você pode invocar ao arrastar os diretórios a serem copiados usando o botão do mouse direito e escolhendo no submenu Drop Here
.)
Isso copiará toda a árvore de diretórios, todos os subdiretórios e arquivos, além de replicar junções, links simbólicos, hardlinks, etc., ajustando-os para que apontem para o mesmo local relativo dentro da árvore recém-copiada.