Ok, então depois de pesquisar e tentar, encontrei uma solução para mostrar os menus de aplicativos ocultos no meu sistema.
Por favor Note: O gnome-shell original, sem ser ajustado, não tem esse problema.
O problema é principalmente causado por GlobalMenu que ainda não é suportado pelo modo Gnome3-fallback .
Então, o que eu fiz foi desativar o GlobalMenu e ter meus menus do aplicativo novamente, e aqui está como eu fiz:
Primeiro, precisamos do dconf-editor , então vamos instalar o dconf-tools
sudo apt-get install dconf-tools
após a instalação, pressione ALT + F2 e digite dconf-editor e pressione Enter.
agora navegue até org / globalmenu e desmarque ativado .
Você pode sair e fazer login novamente ou reiniciar o sistema, e os menus do aplicativo estarão prontos para serem usados novamente.