Infelizmente, a numeração de legendas é baseada em estilos de título (diferentemente das listas multiníveis, que podem ser baseadas em qualquer estilo). No entanto, eu encontrei uma solução alternativa. Na caixa de diálogo Legenda, selecione o botão Nova legenda ... e crie o rótulo. Figura A-. Use esse rótulo para todas as figuras no Apêndice A, e elas aparecerão numeradas corretamente como A-1, A-2, A-3.
A principal desvantagem desta resposta é que, como você está criando manualmente um rótulo para cada apêndice, ele pode facilmente ficar confuso se os apêndices forem adicionados ou excluídos. Além disso, se você tiver um grande número de apêndices, criar rótulos de figura para cada um deles também pode levar mais tempo do que vale a pena.