Normalmente, uma CPU quente significaria uma CPU altamente ativa, mas pode haver um caso estranho em que poderia significar alta E / S.
Eu pessoalmente encontrei este estranho caso no meu laptop na semana passada. Eu baixei o Process Monitor e peguei uma amostra de rastreamento e vi que estava gastando muito tempo lendo um arquivo de inventário de 3GB. Como você, o uso da CPU foi baixo, mas o laptop estava quente. Faça o download do Process Monitor, faça um rastreamento e vá para Ferramentas e conte as ocorrências e veja qual é o arquivo mais acessado no rastreamento.