Há muitas incógnitas aqui, então responder totalmente é bastante complexo.
Você está após o registro de aplicativos ou o registro no nível do servidor? Além disso, qual microsoft OS você está executando? Qual versão do IIS você está executando?
Como um bom ponto de partida, recomendo enfaticamente que você ative o log do IIS. Isso pode ser feito seguindo as instruções deste artigo . Isso permitirá que você acompanhe o acesso aos seus sites e é um bom lugar para começar.
Se você puder ser mais específico sobre quais aspectos do seu site você deseja registrar, podemos sugerir mais.
Espero que isso ajude