Sim, devilspie ou wmctrl faria algo próximo do que estou perguntando. Link Ubuntu / Gnome: Abra um aplicativo em um espaço de trabalho específico - wingedsubmariner deixado nos cometas por @wingedsubmariner me levou a esses dois utilitários.
Essencialmente, para responder à pergunta - uma vez que os programas foram abertos ...
wmctrl -r mozilla -t 0 wmctrl -r mozilla -t 1