Eu tenho tido um problema semelhante: o Windows estava congelando por até 4 minutos quando eu conectei uma unidade flash. No começo eu pensei que estava digitalizando ou comprimindo, mas eu também encontrei um padrão no Defrag, que exigia que desfragmentasse todos os discos quando conectado. Eu desliguei isso!
Finalmente, fiz um relatório de desempenho (Action Center) e descobri que, a partir de um relatório de falhas, eu ainda estava executando o Java v7, current is v10. Eu instalei a v10, reiniciei e tudo parece bom por enquanto. Flash drives abrir imediatamente.
Ainda tenho um problema com associações de arquivos e reprodução automática - quando vou para Programas padrão (botão Iniciar) e tento abrir "Associar tipos de arquivo a programas", o Windows Explorer congela e, em seguida, força uma reinicialização. Portanto, não posso alterar associações de arquivos.