Somente sua máquina é afetada?
Você já tentou / ou pode tentar um switch / roteador diferente?
Os protocolos HTTP / WWW permitem a perda de pacotes / perda de conexões e são feitos para serem resilientes.
A maioria dos protocolos de rede permite pequenas perdas / falhas, mas você terá problemas - problemas muito parecidos com os seus.
A negociação automática está relacionada à velocidade e não à qualidade da conexão. A economia de energia da NIC só entrará em vigor se a conexão / máquina estiver inativa.
Uma coisa mais fácil de tentar (antes de reinstalar) seria uma placa LAN diferente, então (meu próximo passo) seria uma instalação viva / nova em um disco rígido diferente para ver se o problema está relacionado ao hardware (ou OS / motoristas).