O que eu entendo é que o Windows 7 não será instalado nas unidades GPT (GUID Partition Table). É claro, todos os novos Macs têm suas unidades particionadas dessa forma e, quando você executa o assistente de boot camp, ele aproveita a GPT para redimensionar sua partição principal e liberar espaço para o instalador do Windows criar um NTFS. (ou qualquer outra) partição.
Claro, isso não elimina seu disco e reparticiona com MBR (Master Boot Record), já que todos os seus dados estão intactos no final. Então, eu acho que o assistente está adicionando um MBR ao lado do GPT, ou criando algum tipo de tabela de partição híbrida?
Segundo: é bastante fácil usar o Utilitário de Disco para redimensionar sua partição principal e deixar espaço livre. É possível "manualmente" fazer o que mais o Assistente do Boot Camp estiver fazendo para preparar a unidade para o Windows?
Contexto: meados de 2010 iMac Core i5, Mac OS X 10.7.4, Boot Camp 4.0.3, Windows 7.
O Assistente do Boot Camp cria uma tabela de partições híbrida. A GPT presente por padrão é sincronizada com um MBR.
As tabelas de partições do MBR só podem manipular até quatro partições, portanto, qualquer coisa além da sua GPT não será sincronizada.
O Utilitário de Disco não pode fazer isso, mas o gptsync do rEFIt será usado.