O que você deseja alcançar não é quase impossível, mas é muito difícil, já que você precisa modificar o JRE usado.
Portanto, uma abordagem mais fácil é usar o Java apenas nas páginas da Internet em que você confia. Isto pode ser feito, e. no Firefox em combinação com o add-on NoScript. O NoScript desabilita por padrão todos os plugins - eles são mostrados apenas se os usuários habilitarem o domínio temporário ou permanente.