Eu tenho a mesma configuração. Eu encontrei três maneiras, nenhuma das quais é ideal.
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Desative o compiz e use a metacity.
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Você pode adicionar as seguintes linhas à seção "Tela" do seu arquivo xorg.conf para tratar os dois monitores como uma exibição grande:
Option "Xinerama" "1"
Option "NoTwinViewXineramaInfo" "True"
Depois que você fizer logout e logar novamente, seus monitores funcionarão como uma tela. Observe que você obterá um comportamento inesperado, como os painéis do gnome, abrangendo os dois monitores, e também perderá a capacidade de maximizar em apenas um monitor. -
Este parece ser um bug. Arraste a janela para a esquerda (ou direita, dependendo da sua configuração) com a maioria da janela fora da tela. Agarre a borda visível da janela e estique-a pelos dois monitores. Deixe o máximo de espaço vazio que você arrastou da tela. Agora arraste-o de volta para que fique totalmente nas duas telas. Parece que pelo menos metade da janela deve estar fora da tela para que esse truque funcione.