Se você tem acesso root, ligue seu terminal e escreva
su
Password: (enter your root password here.)
Agora monte seu HDD (se ainda não estiver montado). E digite
chown -R "username_youwant" path_to_folder/folder_name
E agora você terminou!
Geralmente, é uma boa prática montar seus HDDs no diretório /media
ou /mnt
.