Sugestão ligeiramente diferente. Não necessariamente melhor. Cada usuário tem que decidir como ele usará o sistema.
Eu prefiro ter / (root) no SSD, mas não em separado / boot ou qualquer outra partição do sistema. E eu deixo / home dentro da raiz para que as configurações do usuário também estejam na unidade mais rápida. Mas, em seguida, crie uma partição de dados na unidade rotativa para todos os dados e vincule os dados de volta a / home para que pareça que está tudo em / home.
Meu SSD de 64GB tem duas / instalações, uma 12.04 e 14.04 a cada metade do SSD, provavelmente substituirei 12.04 quando o 16.04 for lançado. Eu também mantenho todos os dados no disco rígido, mas também tenho instalações de teste (pelo menos uma razoavelmente atual) para que o disco rígido possa ser inicializado em uma emergência se houver problemas com o SSD. Cada instalação de teste tem 20 ou 25 GB e eu vinculo nas partições de dados, então tudo é configurado da mesma forma.