Você diz que as portas USB estão acessíveis. Se eles são do tipo que estão na frente da máquina, eles geralmente são conectados à placa-mãe usando um cabo que você pode simplesmente desconectar da placa-mãe. As portas ainda estão lá, mas não têm conexão elétrica com o computador.
A menos que eles estejam montados na placa-mãe, o que geralmente é o caso na parte de trás da máquina. Você não pode simplesmente desconectá-los, mas já que você diz que a máquina está engaiolada, talvez a parte traseira não seja um problema em primeiro lugar.