Se você está compilando o código C #, você pode usar a opção /keyfile
para o compilador na linha de comando, assim:
csc.exe /keyfile:strong.snk /out:My.exe File.cs
Ou, se estiver usando o Visual Studio, você pode definir a chave de nome strong nas configurações do projeto na guia "Assinatura", marcar a opção "Assinar a montagem" e especificar o arquivo de chave.