o arquivo vmdk é o disco rígido da sua vm. se estiver faltando, não há nada que possa ser feito.
para verificar se está lá, encontre o arquivo da sua máquina virtual. clique com o botão direito e mostre o conteúdo do pacote. encontre o arquivo .vmx e abra-o em um editor de texto. faça uma busca por vmdk, e você pode ver algo como
scsi0:0.fileName = "Windows 7.vmdk"
esse é o nome do seu disco de máquina virtual. tente uma pesquisa de holofotes para ver se você a moveu para outro lugar. Outra opção é verificar se há arquivos realmente grandes no conteúdo do pacote vm. se houver uma série de arquivos de 2GB ou um arquivo grande (> 5gb), estes podem ser arquivos vmdk que foram renomeados ou corrompidos de alguma forma.
a razão pela qual não está em seus backups é porque a máquina do tempo não faz backup dos arquivos vmdk. veja os fóruns vmware para estratégias de backup de fusão .