Parece que a Microsoft resolveu esse problema na Windows 10 Insider Preview Build 17040 para PC
We fixed an issue where inactive window scrolling wouldn’t work if Excel 2016 was in focus.
Para aqueles que não estão inscritos nos Builds do Insider Preview, devemos aguardar até que a Microsoft considere isso pronto para ser lançado. No momento da resposta original, o lançamento público é a versão 1709.
O lançamento público agora é a versão 1803 e isso parece ser corrigido!